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史俊鹏课题组在Plant Communications发表论文构建禾本科高粱族在线分析平台“禾亩”
发布时间:2024-05-06 来源: 阅读量:
2024年4月8日,中山大学农业与生物技术学院史俊鹏为通信作者在学术期刊Plant Communications发表了关于禾本科高粱族多组学在线分析平台“禾亩”的研究论文。
“禾亩”集成了20个高粱族物种的78个基因组的底层信息,结合玉米、高粱、甘蔗、芒草、薏苡等多个组织的超过4700份RNA-seq数据,可以实现用户任意感兴趣基因的转录组图谱构建、系统进化分析、功能富集分析、转座子演化和表达分析、以及玉米和高粱的表观数据查询等(图1)。用户可以通过访问网站https://shijunpenglab.com/HEMUdb/,在线提交分析任务,并一站式获得分析结果和相关图表。
图1 禾亩数据库的多组学数据和分析工具
史俊鹏,中山大学农业与生物技术学院副教授,博士生导师,入选第七届中国科协青年人才托举工程项目。长期聚焦玉米及近缘种的比较基因组学研究,在Nat Genet、Nat Commun、Mol Plant、Plant Commun、Plant Physiol等以通信和第一作者(含共同)发表论文10余篇。