2025年3月12日，中山大学农业与生物技术学院史俊鹏副教授作为唯一通信作者在Nature Communications发表了关于利用进化约束解析与玉米物种形成和驯化相关的调控序列的研究论文。

该研究构建了玉米B73自交系12个组织的ATAC-seq数据，鉴定到80365个染色质开放区（accessible chromatin regions, ACRs）。通过与禾本科34个物种高质量基因组的比较，发现约1/3的ACRs为玉米基因组特有，并且这些调控序列所靶向的基因功能显著富集在花器官发育等生物过程，暗示这些调控序列及基因可能参与了玉米物种特有的表型建成。进一步，通过与高质量的栽培与野生玉米基因组比较，鉴定到856个和玉米驯化相关的ACRs，其靶标的基因在大刍草与玉米之间有更高的差异表达比例。该研究建立了一套利用进化约束鉴定作物驯化重要调控序列的方法，并为后续的玉米遗传位点挖掘和分子育种提供了候选位点。

图 玉米ACRs在禾本科物种间的进化约束分析

    史俊鹏，中山大学农业与生物技术学院副教授，博士生导师，入选第七届中国科协青年人才托举工程项目，长期聚焦玉米基因组调控序列的演化和功能研究，在Nat Commun（2025）、Nat Genet（2023）、Mol Plant（2023）、Plant Commun（2024，2023）、Plant Physiol（2024）等以通信和第一作者（含共同）发表系列论文。主持国家自然科学基金面上项目（2项）、深圳市优秀青年科学基金项目、广东省重点领研发计划项目和深圳市可持续发展专项重大项目子课题等。